Historia

W opuszczonej placówce Pradawnych na Antarktydzie naukowcy odnajdują Gwiezdne Wrota, którymi przenoszą się do zaginionego przed laty miasta Pradawnych – Atlantydy. Bohaterowie na miejscu odnajdują opuszczone miasto w doskonałym stanie. Badając je odkrywają, że jest ono zanurzone pod wodą, a przed zalaniem chroni je pole siłowe. Jednak miasto powoli traci energię, a pole zaczyna zanikać. Szukając innych źródeł energii drużyna napotyka nowego wroga – żywiących się ludzką energią życiową Widma. 

Pradawni założyli rozległą sieć Gwiezdnych Wrót łącząc wiele planet w Galaktyce Pegaza, na których "rozsiali" ludzkie życie. Niestety oznaczało to, że Widma zaczęły żywić się ludźmi na tych planetach i ich populacja również wzrosła. Jedynie miasto Atlantis jako jedyne pozostało nietknięte, ponieważ Pradawni będąc na tyle rozwiniętą rasą stworzyli system obronny, który umożliwił im uniknięcia zagłady. 
Widma zaatakowali Atlantis swoją potężną flotą statków (jak to zwykle robią wrogowie), jednak jego osłony przetrzymały ten atak. Pradawni zorientowali się, że nie pokonają Wraith, ponieważ było ich zbyt wiele. Postanowili więc zanurzyć miasto i wrócić na Ziemię.

W ten oto sposób Atlantyda znalazła się pod wodą ponieważ Lantianie nie chcieli by ich dziedzictwo wpadło w niepowołane ręce. Teraz ludzie, którzy przybyli tu przez Gwiezdne Wrota starają się chronić miasto przed Widmami (które w gwoli ścisłości sami obudzili i rozwścieczyli, zabijając ich królową), oraz nawiązywać kontakty z różnymi grupami społecznymi osiedlonymi w Galaktyce Pegaza.